Zostavili kompletný atlas interakcii RNA koronavirusu s ľudskými bunkami

RIA Novosti - Vedci z Nemecka a Spojených štátov zostavili prvý globálny atlas priamych interakcií medzi koronavírusovou RNA SARS-CoV-2 a ľudskými hostiteľskými bunkami. To by mohol byť východiskový bod pre vývoj nových spôsobov liečby COVID-19 a iných infekcií spôsobených vírusmi RNA. Výsledky výskumu sú publikované v časopise Nature Microbiology.

SARS-CoV-2 využíva proteíny hostiteľských buniek na penetráciu a množenie. Doteraz však neexistovali žiadne podrobné informácie o ľudskom proteóme, to znamená o celkových množstvách všetkých proteínov nachádzajúcich sa v ľudských bunkách, ktoré sú v priamom kontakte s vírusovou RNA. Nemeckí vedci z Helmholtzovho inštitútu pre štúdium infekcií založených na RNA Julius-Maximiliánovej univerzity vo Würzburgu vytvorili spolu so svojimi americkými kolegami z Broad Institute v Cambridge prvý globálny atlas priamych interakcií medzi SARS-CoV-2 RNA a ľudským proteómom.

Vedci najskôr infikovali ľudské bunky novým koronavírusom, potom purifikovali vírusovú RNA a pomocou hmotnostnej spektrometrie identifikovali proteíny s ňou spojené.

Autori zistili, že 18 hostiteľských proteínov hrá kľúčovú úlohu pri infekcii koronavírusom. Dve z nich - CNBP a LARP1 - sú obzvlášť dôležité. Pomocou genetických nástrojov autori identifikovali presné väzbové miesta pre tieto dva hostiteľské proteíny vo vírusovom genóme a preukázali, že môžu špecificky inhibovať vírusovú replikáciu.

Autori navyše identifikovali ďalších 20 regulátorov vírusovej replikácie - nízkomolekulárne inhibítory hostiteľských proteínov, ktoré sa viažu na SARS-CoV-2 RNA. Tri alebo štyri z nich skutočne úplne potláčajú vírusovú replikáciu v rôznych typoch ľudských buniek. "Tento výsledok by mohol otvoriť nové spôsoby liečby infekcií spôsobených SARS-CoV-2 a inými RNA vírusmi," uviedli vedci. smi RNA. Výsledky výskumu sú publikované v časopise Nature Microbiology.

SARS-CoV-2 využíva proteíny hostiteľských buniek na penetráciu a množenie. Doteraz však neexistovali žiadne podrobné informácie o ľudskom proteóme, to znamená o celkových množstvách všetkých proteínov nachádzajúcich sa v ľudských bunkách, ktoré sú v priamom kontakte s vírusovou RNA. Nemeckí vedci z Helmholtzovho inštitútu pre štúdium infekcií založených na RNA Julius-Maximiliánovej univerzity vo Würzburgu vytvorili spolu so svojimi americkými kolegami z Broad Institute v Cambridge prvý globálny atlas priamych interakcií medzi SARS-CoV-2 RNA a ľudským proteómom.

Vedci najskôr infikovali ľudské bunky novým koronavírusom, potom purifikovali vírusovú RNA a pomocou hmotnostnej spektrometrie identifikovali proteíny s ňou spojené.

Autori zistili, že 18 hostiteľských proteínov hrá kľúčovú úlohu pri infekcii koronavírusom. Dve z nich - CNBP a LARP1 - sú obzvlášť dôležité. Pomocou genetických nástrojov autori identifikovali presné väzbové miesta pre tieto dva hostiteľské proteíny vo vírusovom genóme a preukázali, že môžu špecificky inhibovať vírusovú replikáciu.

Autori navyše identifikovali ďalších 20 regulátorov vírusovej replikácie - nízkomolekulárne inhibítory hostiteľských proteínov, ktoré sa viažu na SARS-CoV-2 RNA. Tri alebo štyri z nich skutočne úplne potláčajú vírusovú replikáciu v rôznych typoch ľudských buniek. "Tento výsledok by mohol otvoriť nové spôsoby liečby infekcií spôsobených SARS-CoV-2 a inými RNA vírusmi," uviedli vedci.